Construida en una zona lacustre, la CDMX ha enfrentado varias inundaciones históricas; entre el 15 y el 16 de julio 1951, las calles del centro de la capital se cubrieron de agua y sus habitantes tuvieron que usar lanchas para recorrerlas.
Durante el virreinato entre el 20 y 21 de septiembre de 1629 en la llamada noche de San Mateo la inundación alcanzó más de dos metros de altura, como lo registra la cabeza de león en las calles de Madero y Motolinia; la ciudad estuvo inundada cinco años.
En 1975 se inauguró el drenaje profundo de la CDMX con una longitud de más de 153 kilómetros, para desalojar las aguas pluviales y residuales hacia Hidalgo.
El drenaje está conectado con interceptores o túneles subterráneos, que recolectan las aguas de diferentes zonas de la ciudad; el agua del drenaje es sacada a través de tres emisores.